Tempos atrás resolvi que era melhor ter somente um painel na parte inferior da tela. Então mesclei os dois em somente um, deletando o painel superior. Tempos depois achei que o painel restante ficava muito poluído, carregado. Resolvi então retornar à configuração default, qual foi a minha surpresa quando não consegui encontrar em parte alguma nos menus do Gnome uma opção de como fazer isto.

Dando uma goglada me deparei com as seguintes instruções:

Remova o painel restante, na linha de comando digite:
gnome-session-remove gnome-panel

Depois recrie os paineis:
gconftool-2 --recursive-unset /apps/panel gnome-panel &